本季延续前情，继续讲述蝙蝠侠在哥谭市打击犯罪的故事。在派对上，艾薇用她的神奇口红攻击了蝙蝠侠，让蝙蝠侠为她和哈莉的疯狂消费买单。摆脱控制后，蝙蝠侠将艾薇和哈莉绳之以法。双面人绑架了蒂姆·德雷克。在从蒂姆·德雷克那里得到钥匙后，双面人下令杀了蒂姆·德雷克。幸好蝙蝠侠及时赶到，救下了蒂姆·德雷克。蒂姆·德雷克告知了蝙蝠侠关于双面人的信息，蝙蝠侠得以逮捕双面人。蒂姆·德雷克也受到了蝙蝠侠的培养，成为了新的超级英雄。急冻人故意毁坏了博物馆的恐龙骨架，他对马德森博士说，这么做的原因就是为了让博士难过。蝙蝠侠经过侦查，发现急冻人阴谋毁灭整个哥谭市。经过艰难的战斗，蝙蝠侠阻止了急冻人的阴谋。双面人扮作了法官到处攻击恶人。不明真相的官员还试图与他展开合作。蝙蝠侠通过追查线索发现了真相，拆穿了假法官的真面目。

Reduced to doing Paxton Power's dirty work, The Royal Flush Gang begins to fall apart while Batman has to clean up the mess.

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在成为蝙蝠侠后，布鲁斯·韦恩一直在暗处守护着哥谭市，和自己的得力助手“罗宾”——迪克·格雷森一起打击罪犯。蝙蝠侠的打击，导致商人索恩损失了上千万美元，为了解决这个心头大患，他找来了职业杀手贝恩，见识到了贝恩的强大后，他对此次计划信心十足。贝恩首次出手就不费吹灰之力地解决了超级罪犯鳄鱼人，尾随鳄鱼人到来的蝙蝠侠只见到了奄奄一息的罪犯和被破坏了的蝙蝠车。通过鳄鱼人的描述，蝙蝠侠得知了贝恩的消息，并顺藤摸瓜查清了对方的来历——以囚犯为素材通过化学实验打造而成的超级战士。不久之后，罗宾在一次行动中被贝恩抓到，对方以此为要挟唤来蝙蝠侠，赶来救人的蝙蝠侠与贝恩战作一团，他趁机救出罗宾，并让贝恩的化学药剂注射过量，最终击败了对方。然而这只不过是蝙蝠侠经历过的一次危机而已，还有无数的危险在等着他，未来他也将毫不畏惧地打击罪犯，守护哥谭市的和平。

华纳兄弟于1992年推出的《蝙蝠侠：动画系列》被认为是史上最经典的超级英雄动画之一。本季共有65集，分为多个独立故事，每一集讲述蝙蝠侠在哥谭市打击犯罪、面对各类超级反派的冒险，同时展现了布鲁斯·韦恩作为蝙蝠侠的心理斗争和成长。布鲁斯·韦恩化身蝙蝠侠，在哥谭市与犯罪分子斗争。他与警察局长詹姆斯·戈登和阿尔弗雷德密切合作，调查案件、打击犯罪，同时保护无辜市民。迪克·格雷森作为罗宾登场，探讨了他的成长经历及他与布鲁斯·韦恩的关系。剧集展现了哥谭市的腐败与混乱，警方内部存在贪污问题，黑帮势力横行，而市民生活在恐惧之中。本季不只是讲述英雄打击犯罪，还深入探讨了布鲁斯·韦恩的内心世界。他被父母的死亡阴影笼罩，时常思考自己的正义之路，并在面对反派时不断衡量自己的道德底线。